Огляд секвенування всього екзома (WES)

Секвенування всього екзома (WES) - це молекулярно-генетичний процес, який може бути використаний для виявлення чергувань в генах. Цей метод є відносно новим, і, оскільки технологія швидко розвивається, очікується подальше дослідження та відкриття більш практичних клінічних цілей.

Генетичне тестування стає дуже популярним - ви можете придбати продукти, на яких використовуються зразки волосся або слини, щоб визначити певні генетичні риси та дізнатись, який етнічний походження є частиною вашого походження.

WES дещо відрізняється від цього типу генетичного тестування, оскільки використовується для виявлення відхилень увсіваших генів, навіть якщо ці відхилення раніше не були пов’язані з жодною хворобою. Наприклад, не є правильним тестом шукати специфічну генну аномалію, як гени, виявлені стосовно раку молочної залози.

Як працюють гени

WES може бути використаний для пошуку закономірностей виявлення генетичної причини медичного захворювання. Ваші хромосоми - це молекули, що містять ваш генетичний код. (У вас 23 пари хромосом - їх також називають молекулами ДНК.) Вони складаються з довгих ланцюгів молекул нуклеотидів. Ваше тіло зчитує послідовність нуклеотидів у ваших хромосомах, виробляючи білки.

Зміни послідовності нуклеотидів у молекулах ДНК пояснюють зміни в ознаках у всіх нас.

Зміни, що викликають захворювання, часто називають мутаціями.

Це допомагає зрозуміти деякі основи генетики, якщо ви думаєте про використання WES.

Гени та геноми

Всі риси вашого організму формуються завдяки виробленню білка. Гени - це нуклеотидні послідовності, які кодують білки, які в кінцевому підсумку продукують ваші ознаки. Усе генетичне кодування всіх ваших 46 хромосом називається вашим геномом.

Екзони

Нуклеотидні зрізи молекули ДНК, що кодують гени, називаються екзонами. Вони вкраплені інтронами, які є нуклеотидними послідовностямине кодуйте ознаки. Один ген може складатися з декількох екзонів, кодуючих множинні білки. На екзони припадає лише 1-2% від загальної кількості ДНК.

Кожен екзон фактично починається з нуклеотидної послідовності, яка спонукає до вироблення білка, і закінчується нуклеотидною послідовністю, яка спонукає припинити вироблення білка.

Екзом

Всі екзони у всьому наборі хромосом називаються екзомами. Послідовність геному всього екзома розглядає весь ваш екзом, щоб виявити відхилення, які можуть бути причиною захворювання або проблеми зі здоров'ям.

Обмеження

WES досить великий, і він вивчає всі гени у вашому тілі. Однак він взагалі не досліджує інтрони. Вважається, що інтрони можуть мати певний вплив на ваше тіло, хоча цей ефект до кінця не вивчений і в даний час вважається не таким впливовим, як вплив екзонів.

Процес

WES використовує зразок крові для аналізу ваших геномів. Кожна клітина вашого тіла містить повну копію всіх 46 ваших хромосом, тому клітини крові є достатніми для цього типу тесту.

Тестування WES використовує молекулярну техніку, звану гібридизацією, яка порівнює нуклеотидну послідовність відібраної ДНК із стандартною або “нормальною” послідовністю ДНК.

WES може підхопити мутації, про які вже відомо, що викликають захворювання, а також може виявити зміни в генетичному коді, які ще не були пов'язані із захворюванням.

Де тестуватися

Є багато лабораторій, які проводять послідовність послідовностей цілого екзома. Якщо ваш лікар хоче, щоб у вас була секвенування всієї екзоми, у вас може бути взята кров у кабінеті лікаря, а зразок може бути відправлений у спеціалізовану лабораторію для інтерпретації.

Якщо ви проходите тест без замовлення лікаря, ви можете зв’язатись із спеціалізованою лабораторією, яка безпосередньо проводить тестування WES, і попросити їх проінструкції.

Вартість

Важливо перевірити вартість тестування, а також перевірити, чи покриє Ваша медична страховка вартість тесту. WES - це відносно новий тип технологій, і ваша страхова компанія може покривати або не покривати витрати, залежно від їхніх полісів.

Якщо ви плануєте самостійно оплатити тест, вартість може становити від 400 до 1500 доларів.

Міркування

Якщо ви або ваша дитина збираєтеся провести геномну послідовність, вам слід знати про наслідки. Існує безліч речей, які слід врахувати, перш ніж проходити WES.

Конфіденційність

Генетичні результати можуть стати частиною вашої медичної картки, особливо якщо лікар призначив вам обстеження і якщо за це платить ваша медична страховка. Ваша медична страхова компанія, компанія, яка проводить тест, і потенційно будь-який з їх постачальників (або хтось, хто зламає їхні комп’ютерні системи) може дізнатися, чи є у вас гени будь-якої відомої генетичної ознаки.

Беручи до уваги, що це генетичні тести, є наслідки, які можуть вплинути на людей, які також пов’язані з вами. Незважаючи на те, що існують закони, що захищають вашу конфіденційність, та нормативні акти, які попереджають існуючі умови не впливати на ваше охорону здоров'я, цей рівень інформації є безпрецедентним. Щодо конфіденційності, можуть бути непередбачувані особисті та професійні результати.

Усвідомлення сприйнятливості до хвороб

Багато людей стурбовані тим, що геномні тести виявлять більше про їхнє здоров'я, ніж вони спочатку домовлялися. За винятком надзвичайно рідкісних випадків, таких як хвороба Хантінгтона, генетичне тестування не виявляє медичного майбутнього людини.

Це може виявити, в більшості випадків, що людина має підвищений ризик різних медичних розладів. Оскільки людина настільки ретельно перевірена, може бути виявлено кілька відхилень. Однак багато хто ніколи не призведе до конкретного захворювання або стану.

На цьому етапі відкриття, ймовірно, ніхто навіть не зможе зрозуміти, які саме медичні наслідки мають майбутнє людини, або які "відхилення" призведуть, наприклад, до певної хвороби або стану.

Визначення тесту

Існує кілька подібних генетичних тестів, які оцінюють ваші хромосоми інакше, ніж WES, і у кожного з різних типів тестів є переваги та недоліки.

Хромосомний аналіз

Хромосомний аналіз також описується каріотипуванням. Цей тест може проаналізувати всі ваші хромосоми, щоб побачити, чи є зміни, наприклад, додаткова копія хромосоми або відсутня хромосома.

Хромосомне тестування також може виявити істотні зміни в структурі хромосом, такі як подовжені або короткі хромосоми.

Каріотипування може ідентифікувати такі захворювання, як синдром Дауна, при якому є додаткова копія хромосоми 21. Однак він не може виявити невеликі мутації гена.

Вся геномна послідовність

Ціла геномна послідовність подібна до послідовності цілого екзома, за винятком того, що вона є більш обширною. Він розглядає весь геном, включаючи послідовності інтронів. Ціле геномне секвенування також дорожче, ніж секвенування цілого екзома.

Молекулярно-генетичні тести

Ці дослідження, також описані як генетичне тестування мікрочипів, порівнюють невелику ділянку вашої ДНК з відомими генами або з вибраною послідовністю ДНК, щоб знайти зміни або відомі мутації в певній області хромосоми.

Ці тести корисні, якщо у вас є симптоми стану, спричинені мутацією у відомому місці хромосоми, наприклад, гени хвороби Хантінгтона та деякі гени раку молочної залози.

Слово з дуже добре

WES все ще є відносно новим методом генетичного тестування, і поки не до кінця зрозуміло, як його найкраще застосувати на практиці.

Якщо ви або кохана людина проходите генетичний тест, слід врахувати серйозні проблеми. Якщо лікування підозри на генетичний стан пристосоване до генетичного дефекту, ви потенційно зможете багато чого отримати від тесту. Навіть якщо тест не вплине на ваше лікування, результати можуть бути корисними для розуміння вашого прогнозу та сповіщення членів сім'ї, що вони можуть бути під загрозою. Обов’язково ретельно продумайте, як ви будете реагувати на нормальні або ненормальні результати, і ретельно продумайте свою конфіденційність перед проведенням тесту.