Смедеревац / Гетті
Ключові винос
- Частинки вірусу COVID-19 були виявлені під час планового тестування стічних вод гуртожитків в Університеті Арізони.
- Школа негайно провела тестування учнів та співробітників та виявила двох людей, які були позитивними на COVID-19, але не мали симптомів.
- Історія викликала у людей запитання, чому більше громад не проводять дослідження сечі та фекалій на COVID-19.
- Експерти кажуть, що система тестування вже переобтяжена, і додавання додаткових зразків лише додасть повільного темпу результатів.
Регулярно перевіряючи стічні води в гуртожитках, Університет Арізони виявив у зразках вірус, який викликає COVID-19. Університет відповів негайними заходами, щоб зупинити потенційний спалах, але ця історія підняла питання щодо чому зразки сечі та стільця ще не додані до варіантів тестування на COVID-19.
"Це все насправді досить нове", - говорить Аарон Пікок, доктор філософії, директор з молекулярної біології в Microbac Laboratories, Inc, дуже добре. "Це насправді не робилося регулярно ... більшість цих компаній, які проводять [тестування] стічних вод, є нашими комунальними компаніями, тому вони перебувають у містах або округах, або вони є комунальними районами, і вони" сильно регулюється ".
Павич не брав участі у тестуванні стічних вод гуртожитків в Університеті Арізони, але лабораторії Microbac в даний час співпрацюють з іншими коледжами та університетами, щоб перевірити свої стічні води на наявність вірусів SARS-CoV-2.
Компанія також співпрацює з деякими містами та муніципалітетами, які виділили фінансування на тестування на SARS-CoV-2. Павич каже, що тестування стічних вод під час пандемії - і в іншому випадку - може доповнити інші методи тестування, щоб дати кампусам, підприємствам і громадам ширшу картину проблем, що попереду.
Моніторинг тенденцій зараження громади
Тестування зразків стічних вод на вірусний вміст COVID-19 відрізняється від тестування однієї людини за раз. Різні моделі та алгоритми можуть допомогти відстежувати загальну кількість активних інфекцій у певній місцевості, а дані можуть допомогти інформувати громаду про те, чи збільшуються випадки зараження, знижуються чи залишаються однаковими.
"Якщо ви подивитесь на це так, ви опинитесь на повітряній кулі на висоті 10 000 футів, дивитесь вниз на ліс і дасте загальне уявлення про те, що відбувається в лісі.Але коли ви випробовуєте окремих людей, ви випробовуєте окремі дерева ", - говорить Павич.
Павич каже, що ГРВІ-CoV-2 можна пролити у фекаліях людини до появи симптомів.
"Це свого роду попередник того, що може сходити на щуку для активних інфекцій", - говорить він.
За цією логікою виявлення частинок вірусу у стічних водах може допомогти громадам швидше виявити випадки COVID-19, саме це і сталося в Університеті Арізони.
Шкільний Центр стійких технологій з питань води та енергетики перевіряв стічні води з гуртожитків кампусу протягом першого тижня особистих занять. Вони виявили наявність ГРВІ-CoV-2 в одному гуртожитку. Під час тестування студентів та співробітників у цьому місці вони виявили двох осіб, які були позитивними на вірус, але не мали симптомів.
Як зазначено в заяві університету, в рамках стратегії кампусу «Тестувати, простежити, лікувати» всі студенти повинні були пройти негативний тест на антиген, перш ніж вони зможуть переїхати до залів проживання.
"Тут вся справа в термінах", - говорить Джагдіш Хубчандані, доктор філософії, кандидат медичних наук, MBBS, професор громадського здоров'я в Університеті штату Нью-Мексико. "Я думаю, що сьогодні, якщо ви мене випробуєте, сподіваюся - і, швидше за все, - я негативно. Але ти залишаєш мене одного на три дні. За ті кілька днів, можливо, я пішов до місцевого продуктового магазину чи познайомився з деякими людьми, і заразився ”.
Ловля випадків до появи симптомів
Згідно з дослідженнями Johns Hopkins Medicine, коли людина проходить тестування в перші дні зараження COVID-19, результат може призвести до помилково негативного результату.
Для дослідження, яке було опубліковане вАннали внутрішньої медицинибули розглянуті дані 1330 зразків, які пройшли тестування ланцюгової реакції зворотної транскриптази на полімеразу (RT-qPCR). Дослідники розрахували щоденні хибнонегативні показники, використовуючи результати тесту та повідомлену дату зараження або час появи симптомів.
За їх підрахунками, особи, які проходили тестування на вірус протягом чотирьох днів після зараження, мали на 67% більше шансів отримати негативний результат, а тому отримували помилково негативний результат. Тест виявився точнішим через вісім днів після зараження, але навіть тоді показник хибнопозитивних результатів становив 20%.
"Навіть коли я заражаюсь, - гіпотетично пояснює Хубчандані, - спочатку протягом перших 7-10 днів - або навіть два тижні для деяких людей - у мене немає симптомів, але я все ще продовжую проливати вірус".
Університет Арізони переселив двох студентів, які пройшли позитивний тест на COVID-19, із залу проживання на карантин. Студенти продовжуватимуть заняття в Інтернеті, доки вони не зможуть безпечно повернутися до гуртожитку та особистого навчання.
Після того, як учнів помістили на карантин, шкільний Центр стійких технологій з питань води та енергетики знову перевірив стічні води гуртожитку і не виявив слідів вірусу.
Якщо вірус переливається в тілесні відходи і потенційно може бути використаний для виявлення коронавірусу раніше тестів на COVID-19, таких як мазок з носоглотки, то чому б більше шкіл та громад не тестувати зразки сечі та калу?
"Аналіз сечі створить додаткові кроки та навантажить тестування", - говорить Хубчандані. Оскільки тестування стрибків напруги та затримок у лабораторіях, що мають відставання, вже є проблемою, тестування фізичних відходів для людей буде додатковою проблемою.
Як перевірити стічні води на COVID-19
Павич пояснює, що лабораторії Microbac отримують репрезентативну пробу одним із двох способів. Перший - це так званий тест на захоплення, коли збирається випадкова вибірка. Другий - це складене випробування, де встановлюється прилад для збору стічних вод кожні 15 або 20 хвилин.
Далі рН зразка регулюється, щоб змусити частинки вірусу прилипати до інших частинок, що сприяє фільтруванню. Потім екстрагують нуклеїнові кислоти та потенційну РНК вірусу та проводять тест RT-qPCR. Тест "перетворює РНК на комплементарну ДНК, - каже Пікок. - І тоді ця додаткова ДНК зчитується нашим інструментом".
RT-qPCR
РНК перетворюється на додаткову ДНК, синтетичну форму ДНК, виготовлену з шаблону РНК.Тест має багато застосувань, від генетики до клінічних досліджень.
Тест RT-qPCR - це той самий аналіз, який використовується для зразків, відібраних з мазків носоглотки. Однак вам потрібен інший показник для тестування стічних вод. Microbac також тестує на перець м'якого плямистого вірусу (PMMoV).
"Це свого роду найпоширеніший у стічних водах асоційований з людьми вірус", - говорить Павич. Він також використовувався для перевірки якості води. "Ви можете використовувати цей PMMoV, щоб повідомити, скільки людських відходів перебуває у стічних водах у будь-який момент часу", - говорить Павич, посилаючись на необхідність диференціації від людського та промислового вкладу. "І тоді ви можете використовувати це, щоб визначити результати для ваших номерів SARS-CoV-2".
Тестування за межами гуртожитків
"Корпорації, галузі, фабрики та робочі місця можуть бути хорошими місцями для оцінки завантаження вірусу", - говорить Хубчандані. Наприклад, у перші місяці пандемії м’ясокомбінати стали гарячими точками спалаху COVID-19. Перевірка наявності вірусу в стічних водах рослини може допомогти запобігти майбутнім спалам.
Джагдіш Хубчандані, доктор філософії, кандидат медичних наук, MBBS
Я думаю, що я повинен наголосити на тому, що наш найбільший виклик при тестуванні стічних вод чи людей: як ви перекладаєте це на суспільну адаптацію?
- Джагдіш Хубчандані, доктор філософії, кандидат медичних наук, MBBSМіста також можуть використовувати тестування для збору даних з різних підрозділів громади. "Скрізь, де у вас є станція підйомника (насосна колонка) або район, де збирається вода - [чи це] для району чи для середньої школи, ви можете піти перевірити це", - говорить Павич.
Тим не менш, фінансування та тяганина все ще можуть бути перешкодою. «У ситуації з більшою громадою існує багато додаткових витрат на збагачення зразка, щоб отримати правильний тип вірусного навантаження. І багато міст можуть не мати таких видів ресурсів ". - говорить Хубчандані.
Хубчандані також пропонує ще одне важливе питання щодо збору даних. "Я думаю, що я повинен наголосити на тому, що нашим найбільшим випробуванням при тестуванні стічних вод чи людей є: як ви перекладете це на суспільну адаптацію?"
Якщо громада виявить високий тягар COVID-19 шляхом тестування стічних вод, тоді повинні відбутися більш агресивні заходи соціального дистанціювання та тестування людей у цій громаді. Хубчандані додає, що в кінцевому підсумку дані "корисні лише в тому випадку, якщо існує оцінка в режимі реального часу та дії громади, які керуються цією оцінкою".
Що це означає для вас
Незважаючи на те, що ваша громада може не скоро випробовувати свої стічні води на COVID-19, історія з Університету Арізони є нагадуванням про те, що вірус може поширюватися навіть тоді, коли у вас немає симптомів. Продовжуючи вживати належних запобіжних заходів щодо соціального дистанціювання, одягаючи маску та виконуючи ефективну гігієну рук, все ще найкращими способами захистити вас, вашу сім’ю та вашу громаду.
.jpg)
